Estuve corriendo las simulaciones de la solvatación de la insulina por 30ns y tuvimos varios resultados interesantes. En general, la estructura tridimensional de la proteína se compacta más cuando es solvatada en DMSO mientras que en CCl4 la estructura se expone más al solvente. El próximo paso es analizar estos resultados en cuanto a cuáles son la propiedades que influyen en este comportamiento como por ejemplo las interacciones no covalentes entre solvente-proteína, especificamente interacciones hidrofóbicas, interacciones hidrofílicas, puentes de Hidrógeno e interacciones electrostáticas.
El video arriba muestra un ejemplo de las simulaciones que hago pero este ejemplo es solvatación de ciclohexanol en agua.
Aún no hemos podido solvatarla en acetonitrilo debido a que no hemos conseguido los parámetros conocidos como ‘la topología’ para llevar a cabo la simulación.
En cuanto a técnicas aprendidas, aún estoy en proceso de seguir dominando las técnicas aprendidas desde enero como por ejemplo aprender a usar los programas y todos los features que puedo hacer con ellos.
Se espera que en las próximas semanas comienze con un training para aprender a utilizar el equipo del laboratorio en el cual voy a estar trabajando con la encapsulación de insulina, por ejemplo: metros de pH, centrífuga, diferentes microscopios, etc.
